(1) Framleiðsluskilvirkni geislaborunarvélarinnar er lítil. Þegar EDM er notað sem grófgerð til mótunar, þó að sniðið sé gott, getur skurðarvirkni þess aðeins jafngilt tækjarennibekk. Þess vegna, fyrir hluta sem hægt er að vinna með málmskurðaraðferðum, er EDM almennt ekki talið.
(2) Vinnustykkið sem á að vinna getur aðeins verið leiðari.
(3) Það er rafskautatap. Þar sem rafskautatap á sér stað venjulega við brún skarpa hornsins, hefur myndunarnákvæmni áhrif. Til þess að uppfylla nákvæmniskröfur er oft krafist kostnaðar við mörg rafskaut og viðbótartíma fyrir rafskautaskipti.
(4) Það er myndbreytt lag á vélræna yfirborðinu. Bráðabirgðarannsóknir hafa sýnt að yfirborð vinnustykkisins sem á að vinna hefur að jafnaði myndbreytt lag, eins og myndbreytt lag á yfirborði ryðfríu stáli og sementuðu karbíði, sem er skaðlegt í notkun og þarf að farga.
(5) Vinnsluferlið verður að fara fram í vinnuvökvanum. Losunarhlutinn verður að vera í vinnuvökvanum meðan á EDM stendur, annars mun það valda óeðlilegri losun.